Rutinně prováděná vyšetření - laboratoř molekulární biologie

Metoda: PCR

Indikace: průkaz produktivní infekce HCV- stanovení replikace viru

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Metoda: PCR

Indikace: monitorování replikace viru - úspěšnosti léčby

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: < 600 IU/ml nebo např. 2E+5 IU/ml (200 000 IU/ml)

Výsledek do: 2 týdnů, provádí se pouze u RNA HCV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Metoda: PCR

Indikace: stanovení genotypu HCV - podklad pro postup léčby

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: 1a, 1b, 2a, 2b, 3a

Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u RNA HCV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Metoda: PCR

Indikace: průkaz produktivní infekce HBV - stanovení replikace viru monitorování replikace viru - úspěšnosti léčby

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, do 1E+05cp/ml slabě POZITIVNÍ + kvantita,

nad 1E+05cp/ml POZITIVNÍ + kvantita

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Metoda: PCR

Indikace: stanovení genotypu HBV - podklad pro postup léčby

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku:typ A, B, C, D, E, F

Výsledek do: 1 měsíce

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Metoda: PCR

Indikace: podklad pro postup léčby, průkaz mutací v oblasti PreCore

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem

Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u DNA HBV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Metoda: PCR

Indikace: podklad pro postup léčby, průkaz mutací v oblasti Basal Core Promotor

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku:NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem

Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u DNA HBV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Metoda: PCR

Indikace: podklad pro postup léčby, průkaz mutace v oblasti YMDD

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem

Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u DNA HBV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Metoda: PCR

Indikace: podklad pro postup léčby, průkaz mutace v oblasti Polymerase gene

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem

Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u DNA HBV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Metoda: PCR

Indikace: průkaz produktivní infekce HGV - stanovení replikace viru

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Metoda: PCR z klinických vzorků

Indikace: podezření na TBC

Materiál: krev nesrážlivá 4ml (natricum citricum 3,8% + krev v poměru 1:4), laryngeální výtěr 6 tamp., vzorky z bronchoskopie 3x3x1 mm, moč 50ml, stolice velikostlískového ořechu, sputum, likvor, pleurální punktát, aspirát a další 2ml

Transport: při 4°C až pokojové teplotě max. 1den

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 2 až 7 pracovních dnů

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

Metoda: MTD z klinických vzorků

Indikace: podezření na TBC

Materiál: laryngeální výtěr 6 tamp., vzorky z bronchoskopie 3x3x1 mm, moč 50ml, stolice velikostlískového ořechu, sputum, likvor, pleurální punktát, aspirát a další 2ml

Transport: při 4°C až pokojové teplotě max. 1den

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 2 až 7 pracovních dnů

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního kmene

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázán komplex M. tuberculosis

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního druhu

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázáno M. kansasii

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního druhu

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázáno M. gordonae

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního kmene

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázán komplex M.avium - intracellulare

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního druhu

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázáno M. avium

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního druhu

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázáno M. intracellulare

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

Metoda: PCR

Indikace: infekce herpetickými viry

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,5ml, moč, plodová voda 2ml, stěr*

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média

Metoda: PCR

Indikace: infekce herpetickými viry

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,5ml, stěr*

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ HSV1 nebo HSV2

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média

Metoda: PCR

Indikace: infekce herpetickými viry

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,5ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

Metoda: PCR

Indikace: infekce herpetickými viry

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,5ml, stěr*

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média

Metoda: PCR

Indikace: infekce herpetickými viry

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,5ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku:0 cp/ml (negativní), < 500 cp/ml nebo hodnota cp/ml (pozitivní)
např. 2E+5 cp/ml (200 000 cp/ml)

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

Metoda: genová sonda, PCR

Indikace: onemocnění urogenitálního systému, konjuktivitidy

Materiál: Genová sonda: výtěr z uretry, spojivky (souprava Gen-Probe), výtěr z cervixu (souprava Digene)

PCR: moč, punktáty, výtěr dakronovým* tampónem nebo kartáčkem

Transport: Genová sonda: Při 2-25°C, do 14 dní

PCR: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.

Forma výsledku: Genová sonda: NEGATIVNÍ, SUSPEKTNÍ, POZITIVNÍ (hranice pozitivity: 300)

PCR: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: Genová sonda: 3 dnů

PCR: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316

* odběrová souprava eSwab

Metoda: genová sonda, PCR

Indikace: onemocnění urogenitálního systému, konjuktivitidy

Materiál: Genová sonda: výtěr z uretry, spojivky (souprava Gen-Probe), výtěr z cervixu (souprava Digene)

PCR: moč, výtěr dakronovým* tampónem nebo kartáčkem

Transport: Genová sonda: Při 2-25°C, do 14 dní

PCR: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.

Forma výsledku: Genová sonda: NEGATIVNÍ, SUSPEKTNÍ, POZITIVNÍ (hranice pozitivity: 300)

PCR: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: Genová sonda: 3 dnů

PCR: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316

* odběrová souprava eSwab

Metoda: genová sonda

Indikace: cervikální léze

Materiál: výtěr z cervixu (souprava Digene)

Transport: Při 2-25°C, do 14 dní

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, SUSPEKTNÍ, POZITIVNÍ (hranice pozitivity: 300)

Výsledek do: 3 dnů

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316

Metoda: genová sonda

Indikace: cervikální léze

Materiál: výtěr z cervixu (souprava Digene)

Transport: Při 2-25°C, do 14 dní

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, SUSPEKTNÍ, POZITIVNÍ (hranice pozitivity: 300)

Výsledek do: 3 dnů

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ Influenza A nebo Influenza B

Výsledek do:1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ Parainfluenza 1, 2 nebo 3

Výsledek do:1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem médiem eSwab

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ RSV A nebo RSV B

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem médiem eSwab

Metoda: PCR

Indikace: atypická pneumonie

Materiál: BAL, sputum, tracheální aspirát, bronchiální sekret, pleurální výpotek doporučeno min. 2ml
Na žádanku o bakteriol. vyšetření vysloveně uveďte PCR Legionella!

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Odd. bakteriologie tel.: 596 200 425, 328
Odd. imunologie tel.: 596 200 225

Metoda: PCR

Indikace: atypická pneumonie

Materiál: BAL, sputum, tracheální aspirát, bronchiální sekret, pleurální výpotekdoporučeno min. 2ml
Na žádanku o bakteriol. vyšetření vysloveně uveďte PCR Mycoplasma!

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Odd. bakteriologie tel.: 596 200 425, 328
Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

Metoda: PCR

Indikace: atypická pneumonie

Materiál: BAL, sputum, tracheální aspirát, bronchiální sekret, pleurální výpotek, punktát doporučeno min. 2ml
Na žádanku o bakteriol. vyšetření vysloveně uveďte PCR Legionella!

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Odd. bakteriologie tel.: 596 200 425, 328
Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

DNA N. meningitidis
DNA N. meningitidis typizace B,C
DNA S. pneumoniae
DNA H. influenzae b
DNA L. monocytogenes

Metoda: PCR

Indikace: bakteriální meningitidy

Materiál: likvor 0,5 - 1 ml, plná krev (EDTA nebo citrátová) 5 ml. Materiál odeberte pouze pro vyšetření DNA!!!, sterilně do umělohmotné šroubovací zkumavky. Pro bakteriologické kultivační vyšetření odeberte druhý vzorek.

Transport: likvor při 4°C, krev při pokojové teplotě do 12 h od odběru, nad 12 h od odběru likvor zamražen a krev při 4°C

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Kontakt: Odd. bakteriologie tel.: 596 200 179, 425

Metoda: PCR

Indikace: podezření na boreliózu

Materiál: likvor min.1,5ml, punktát min. 1,5ml, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Oddělení parazitologie a lékařské zoologie Ostrava, tel.: 596 200 326, 240

Metoda: PCR

Indikace: aseptické meningitidy a encefalitidy

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,0ml, stěr*, stolice velikost lískového oříšku

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 7-mi prac. dnů

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

Metoda: PCR

Indikace: pátá nemoc

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

Metoda: PCR

Indikace: příušnice

Materiál:výtěr bukální sliznice*, sliny, moč, likvor 1,0ml, srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem médiem eSwab

Metoda: PCR

Indikace: klíšťová encefalitida

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

Metoda: PCR

Indikace: keratokonjuktivitida

Materiál: stěr*

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média

Metoda: PCR

Indikace: západonilská horečka

Materiál: likvor min.1,5ml, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

Metoda: PCR

Indikace: vyšetření genetické dispozice pro celiakii – nepřítomnost heterodimeru
HLA DQA1*0501/DQB1*0201 (DQ2) vylučuje celiakii na 95%
HLA DQA1*0301/DQB1*0302 (DQ8)

Materiál: EDTA krev, 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: nízké riziko, VYSOKÉ RIZIKO s komentářem

Výsledek do: 1 měsíce

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225