Po čtyřech letech platnosti vyhlášky č.356/2002 Sb. Došlo k její novelizaci vyhláškou MŽP č. 362/2006 Sb. Od 1.8.2006.
Povinnost měření pachových látek zůstává zachována. Významnou změnou je však zrušení limitů na zdrojích. V následujícím období 3 let musí vyjmenované zdroje provést měření pachových látek a výsledky odevzdat na ČIŽP v termínu daném zákonem. Po třech letech by podle záměrů MŽP mělo dojít k nastavení limitů podle typů zdroje. Po nastavení limitů bude vyžadováno jejich plnění.
V období let 2006 - 2009 mají povinnost provést měření střední a větší zdroje rozdělené do tří skupin. Každá skupina má čas na měření 1 rok.
Do 1.8.2007 mají být proměřeny následující typy zdrojů:
1.1 Jatka s kapacitou porážky nad 50t/den
1.2 Zpracování ryb
1.3 Pekárny
1.4 Sušení vajec
1.5 Zpracování čokoládových produktů
1.6 Výroba tabákových výrobků
1.7 Udírny
1.8 Pražírny kávy, kávových náhražek, kakaových bobů nebo oříšků
V novele vyhlášky jsou měřící metody striktně určeny normou ČSN EN 13725, což je určitě pokrok ke sjednocení. Vyhláška však neřeší metodiky odběrů a proto jsou tyto postupy dále záležitostí dohody měřící skupiny a provozovatele pod dohledem ČIŽP. Zároveň jsou úplně zrušeny všechny statistické metody.
Významnou změnou je rovněž §1 vyhlášky, který stanoví, že přípustná míra obtěžování zápachem je překročena vždy, pokud si na obtěžování stěžuje 20 osob a pokud alespoň u jednoho z provozovatelů stacionárních zdrojů bylo prokázáno porušení povinnosti podle zákona…Praktická aplikace tohoto paragrafu bude obtížná.