Průkaz mikroorganizmů metodou polymerázové řetězové reakce (PCR)

PCR PANELOVÉ TESTY:

Bakteriální meningitidy (likvor)

Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Listeria monocytogenes, Streptococcus agalactiae, Escherichia coli K1

Virové meningitidy (likvor)

HSV1, HSV2, VZV, Enterovirus

Virové respirační infekce HCD (výtěr)

Influenza A, Influenza B, RSV A/B, SARS-CoV-2

Respirační infekce HCD (výtěr)

Influenza A, Influenza B, RSV A/B, SARS-CoV-2, Parainfluenza virus,  Adenovirus, Human metapneumovirus, Human rhinovirus/enterovirus, Coronavirus, Bordetella parapertussis, Bordetella pertusis, Chlamydia pneumoniae,  Mycoplasma pneumoniae

Pneumonie (BAL, sputum, aspirát)

Acinetobacter calcoaceticus-baumannii complex, Enterobacter cloacae complex, Escherichia coli K1, Haemophilus influenzae, Klebsiella aerogenes, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae group, Moraxella catarrhalis, Proteus spp., Pseudomonas aeruginosa, Serratia marcescens, Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus pyogenes, Chlamydia pneumoniae, Legionella pneumophila, Mycoplasma pneumoniae, Adenovirus,  Human metapneumovirus, Human rhinovirus/enterovirus,  Influenza A virus, Influenza B virus, Parainfluenza virus, Respiratory syncytial virus

Virové gastroenteritidy (stolice)

Rotaviry, Noroviry, Astroviry, Adenoviry, Sapoviry

Střevní prvoci (stolice)

Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica, Cryptosporidium spp., Blastocystis hominis, Dientamoeba fragilis, Cyclospora cayetanensis

Střevní helminti (stolice)

Enterocytozoon spp., Encephalitozoon spp., Strongyloides spp., Hymenolepis spp., Ascaris spp., Taenia spp., Trichuris trichiura, Ancylostoma spp., Enterobius vermicularis a Necator americanus

Sexuálně přenosné nákazy I (výtěr, moč)

Chlamydia trachomati, Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum

Sexuálně přenosné nákazy II (výtěr, léze)

Lymphogranuloma venereum, Haemophilus ducrey, Trepomena pallidum

Kloubní infekce (punktát)

Anaerococcus prevotii/vaginalis Finegoldia magna Streptococcus spp. Clostridium perfringens Parvimonas micra Streptococcus agalactiae Cutibacterium avidum/granulosum Peptoniphilus Streptococcus pneumoniae Enterococcus faecalis Peptostreptococcus anaerobius Streptococcus pyogenes Enterococcus faecium Staphylococcus aureus Staphylococcus lugdunensis, Bacteroides fragilis Kingella kingae Proteus spp. Citrobacter Klebsiella aerogenes Pseudomonas aeruginosa Komplex Enterobacter cloacae Skupina Klebsiella pneumoniae Salmonella spp. Escherichia coli Morganella morganii Serratia marcescens Haemophilus influenzae Neisseria gonorrhoeae, Candida Candida albicans

PCR SINGLE TESTY:

Neuroinfekce

  • DNA Neisseria meningitidis
  • DNA Streptococcus pneumoniae
  • DNA Haemophilus influenzae
  • DNA Listeria monocytogenes
  • DNA Streptococcus agalactiae
  • DNA Escherichia coli K1
  • DNA obecná bakteriální
  •  
  • RNA Enterovirus
  • DNA HSV1/2
  • DNA VZV
  • DNA CMV (včetně kvantifikace)
  • DNA HHV6 (včetně kvantifikace)
  • RNA Parechovirus
  •  
  • DNA Cryptococcus gattii / neoformans

Infekce horních cest dýchacích

  • DNA Bordetella pertusis
  • DNA Bordetella parapertusis
  •  
  • RNA Influenza A, B
  • RNA Influenza A – typizace (H1, H3)
  • RNA RSV A, B
  • RNA SARS-CoV-2
  • RNA Parainfluenza 1, 2, 3, 4
  • RNA Human metapneumovirus
  • RNA Coronavirus (229E, NL63, OC43, HKU1)
  • RNA Rhinovirus
  • DNA Bocavirus
  • DNA Adenovirus
  • RNA Enterovirus

Infekce dolních cest dýchacích

  • DNA Legionella pneumophila
  • DNA Mycoplasma pneumoniae
  • DNA Chlamydia pneumoniae
  • DNA Corynebacterium diphtheriae
  • DNA M. tuberculosis
  •  
  • DNA Pneumocystis jirovecii
  • DNA Aspergillus sp.
  • DNA Aspergillus fumigatus
  • DNA Aspergillus fumigatus – azolové rezistence
  • DNA Mukormycety

Gastrointestinální infekce

  • Průkaz DNA toxinu B Clostridium difficile
  •  
  • RNA Rotavirus
  • RNA Norovirus
  • RNA Astrovirus
  • RNA Sapovirus
  • DNA Adenovirus
  •  
  • DNA Giardia intestinalis
  • DNA Entamoeba histolytica
  • DNA Cryptosporidium spp.
  • DNA Blastocystis hominis
  • DNA Dientamoeba fragilis
  • DNA Cyclospora cayetanensis
  • DNA střevních helmintů (9 agens)

Virové hepatitídy

  • RNA HAV
  • DNA HBV (včetně kvantifikace)
  • Genotyp HBV
  • Precore HBV
  • BCP HBV
  • Lékové rezistence HBV (lamivudin, adefovir, entecavir, telbivudin, emtricitabin, tenofovir)
  • RNA HCV (včetně kvantifikace)
  • Genotyp HCV
  • RNA HDV
  • RNA HEV

Oportunní infekce

  • DNA CMV (včetně kvantifikace)
  • DNA EBV (včetně kvantifikace)
  • DNA HSV1/2
  • DNA VZV
  • DNA HHV6 (včetně kvantifikace)
  • DNA BK virus (včetně kvantifikace)
  • DNA JC virus

Sexuálně přenosná onemocnění

  • DNA Chlamydia trachomatis*
  • DNA Neisseria gonorrhoeae*
  • DNA Mycoplasma genitalium*
  • DNA Metamycoplasma hominis*
  • DNA Ureaplasma urealyticum / parvum*
  •  
  • DNA Trichomonas vaginalis*
  •  
  • DNA Haemohpilus ducrey
  • DNA Treponema pallidum
  • DNA Lymfogranuloma venereum
  •  
  • DNA HPV high risk, low risk
  • DNA HPV typizace
  • RNA HIV-1 (pouze při poranění)
  • DNA Opičí neštovice

Dětská a exantémová onemocnění

  • RNA Morbilli virus
  • DNA Parvovirus B19 (včetně kvantifikace)
  • DNA HHV6 (včetně kvantifikace)
  • RNA Parotitis
  • RNA Rubeola virus

Zoonózy

  • DNA Bartonella spp./henselae
  • DNA Borrelia burgdorferi
  • DNA Leptospira sp.
  •  
  • DNA Toxoplasma gondii
  • DNA Plasmodium
  •  
  • RNA TBEV (virus klíšťové encefalitidy)
  • RNA West Nile virus
  • RNA Dengue virus
  • RNA Zika virus
  • RNA Chickungunya
  • RNA Žluté zimnice v.
  • RNA Usutu v.
  • RNA Hantavirus

Infekce kůže a kožních adnex

  • DNA Dermatofyty

Mykobakteria

  • DNA M. tuberculosis
  • RNA M. tuberculosis complex
  • DNA M. kansasii
  • DNA M. gordonae
  • DNA M. avium-intracellulare complex
  • DNA M. avium
  • DNA M. intracellulare

Sekvenace

  • Sekvenační identifikace baktérií (16s DNA)
  • Sekvenační identifikace hub (benA,ITS2)
  • Sekvenační identifikace Legionella species (MIP)
  • Sekvenační subtypizace Legionella pneumophila (SBT)

Lidský genom (Informovaný souhlas Dokument ve formátu PDF)

  • CELIAKIE – rizikové HLA alely
  • HLA B27
  • Intolerance laktózy
Služby
klinických laboratoří
 
Easy To Read
Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě
Partyzánské náměstí 2633/7, Moravská Ostrava, 702 00 Ostrava,
tel.: 596 200 111, fax: 596 118 661, podatelna@zuova.cz,
Datová schránka: pubj9r8
Web: zuova.cz